Sant'Andrea lungo il corso, contemporanea alla edificazione della Città, costruita dai monaci avellaniti, è stata restaurata e sopraelevata nel corso del XVI secolo. Al suo interno conserva la pala dell'altare maggiore, opera di Palma il Giovane (attualmente esposta al Museo) ed il fonte battesimale, del bolognese Giuseppe Grossi.
Santa Maria di Piazza, fondata nel primo decennio dell'XI secolo da San Romualdo ed indicata come la chiesa più antica di Pergola, conserva altari e pale, ornati di stucchi. Recentemente è stato rinvenuto un affresco del XV secolo.
San Biagio, la semplice facciata contrasta con l'interno, ricco di tele racchiuse da splendide cornici in legno intagliato e dorato.
Santa Maria Assunta, del 1600, ristrutturata nel 1896, presenta pregevoli tele del pergolese Antonio Concioli.
San Marco, eretta in stile romanico con il primo nucleo storico di Pergola, è stata completamente rifatta nel 1776, nell'altare maggiore custodisce la seicentesca tela "Madonna del Carmelo e Santi" di Giovanni Francesco Guerrieri.